АШУҮИС-ийн төв эмнэлэг нь эрүүл мэндийн тусламж үйлчилгээний чанарын удирдлагын тогтолцоог 2014 оноос нэвтрүүлэн, улс, нийслэлийн мэргэжлийн хяналт шалгалт, хөндлөнгийн үнэлгээнд удаа дараалан амжилттай үнэлэгдэн чанарын баталгаажилтыг ханган, ЭМД-аас хэвтүүлэн эмчлэх тусламж үйлчилгээгээ санхүүжүүлэн, 2018 онд 3 дах удаагаа ЭМСЯ-ны эрүүл мэндийн байгууллагуудын магадлан итгэмжлэлийн шалгуурыг ханган магадлан итгэмжлэгдэн, орны тоог өргөтгөсөн.
АШУҮИС-ийн төв эмнэлэг нь 40 ор бүхий Дотор, Мэдрэл, Мэс заслын хэвтүүлэн эмчлэх тасгууд, зүрх судас, үе судлал, уушиг судлал, элэг ходоод гэдэс судлал, дотоод шүүрэл, бөөр, мэдрэл , чих хамар хоолой, нүд, мэс засал, уламжлалт, сэргээн засах эмчилгээний төрөлжсөн нарийн мэргэжлийн кабинетууд, Дуран, Дүрс оношлогоо, Үйл онош, Клиник лабораторийн тасаг, Эмчилгээний хоол үйлдвэрлэлийн тасаг, Эм хангамж, Төвлөрсөн ариутгал, халдваргүйтгэл, Хангамж үйлчилгээ, Статистик, бүртгэл мэдээлэл зэрэг тасаг нэгжийн, Чанарын алба, Сувилахуйн алба, Халдварын сэргийлэлт хяналтын алба, Инженер техникийн алба болон Орон тооны бус салбар зөвлөл, хороо, алба, багийн бүрэлдэхүүнтэйгээр үйл ажиллагаа явуулж байна.
Манай эмнэлэгт эрүүлийг хамгаалах салбартаа тэргүүлэгч, мэргэжлийн өндөр ур чадвартай, мэргэшсэн, ажлын туршлагатай, нэр хүндтэй, хөгжингүй орнуудад мэргэжил дээшлүүлсэн, чадварлаг эрдэмтэн, профессор, багш, эмч, эмнэлгийн мэргэжилтэн, шилдэг залуучууд их сургуулийн эмнэлгээ хөгжүүлэх нэгэн сэтгэлээр нэгдэн эрүүл мэндийн тусламж үйлчилгээнд орчин үеийн дэвшилтэт арга, технологи нэвтрүүлэн, хүн амд нотолгоонд суурилсан өндөр нарийн мэргэжлийн тусламж үйлчилгээг чанартай, найдвартай, хүртээмжтэй үзүүлэхийг зорин ажиллаж байна.
